Arteether का प्रयोग मुख्य रूप से मलेरिया (Malaria) के उपचार में किया जाता है। इसका उपयोग मलेरिया को रोकने या गंभीर मलेरिया का इलाज करने के लिए नहीं किया जाता (जिसमें यह मस्तिष्क, फेफड़े या गुर्दे को प्रभावित करता है)।